En los torneos subsecuentes comenzó a perder el protagonismo de antaño al tener participaciones intrascendentes en liguillas; quedando eliminado en las fases de cuartos de final en 1991-92, reclasificación en 1992-93, cuartos de final en 1994-95 y reclasificación en 1995-96. En la fase de liguilla del verano 1997, sucumbieron ante Toros Neza por un marcador de 3-4, camiseta arsenal con lo cual se quedaron en la etapa de cuartos de final.
